Missing Banban plonge les joueurs dans une quête palpitante en défilement latéral, où le shérif Toadster se lance dans une mission pour résoudre le mystère d'un ami disparu. Les joueurs navigueront à travers des décors chaotiques tels que des plages et des usines, maniant une gamme d'armes et de pouvoirs uniques. Tout au long de l'aventure, ils devront affronter des versions tordues d'amis lors de combats de boss difficiles, tout en maîtrisant un mouvement précis pour éviter les pièges et les obstacles. Ce gameplay dynamique mêle exploration et combats intenses, créant une expérience palpitante alors que les joueurs luttent contre la montre pour sauver leur compagnon d'une menace ominueuse.