The Flower of Evil: Twins เปิดเผยเรื่องราวในขณะที่ผู้เล่นรับบทบาทนักสืบที่เจาะลึกคดีฆาตกรรมที่เกิดขึ้นเมื่อ 27 ปีก่อน ด้วยการสำรวจในมุมมองบุคคลที่หนึ่ง พวกเขาจะแอบแฝงเข้าไปในห้องทดลอง สำนักงาน และสถานที่อื่นๆ ที่เต็มไปด้วย NPCs ซึ่งมีเรื่องราวที่เชื่อมโยงกับความลับที่ซ่อนอยู่ ตัวเกมท้าให้ผู้เล่นใช้ปัญญาแก้ไขปริศนาที่ซับซ้อน โดยการใช้สิ่งของต่างๆ หมุนวาล์ว และถอดรหัสข้อความที่ซ่อนอยู่ ด้วยรูปแบบการแสดงผลที่โดดเด่น เกมนี้ใช้สไตล์การ์ตูนคอมิกส์ในการเล่าเรื่องอย่างมีชีวิตชีวา ทำให้การสอบสวนแต่ละก้าวเป็นทั้งการผจญภัยทางทัศนียภาพและทางความคิด
