SuperNDS Pro (Emulatore) offre agli utenti strumenti avanzati per ottimizzare le loro sessioni di gioco, consentendo la gestione dei file, backup e ripristino dei file di gioco. Per godere dei giochi, i giocatori devono trasferire i loro file ROM decompresso nella scheda SD o nella memoria interna. È essenziale concedere tutti i permessi di accesso ai file necessari per le migliori prestazioni. Il supporto per il miglioramento continuo dell'emulatore è facilitato attraverso donazioni a varie iniziative open-source. Se si verificano crash legati a poca RAM, liberare la memoria e riavviare l'emulatore può aiutare a risolvere questi problemi.