Ninja Turtles: Legends versetzt dich direkt in das ikonische Universum der Ninja Turtles sowie ihrer Verbündeten und Gegner. In diesem Teil steht eine gewaltige Herausforderung bevor: Krang hat einen perfiden Plan entwickelt, um eine Armee von Mutanten zu schaffen, wofür er die DNA wertvoller Wesen benötigt. Die Spieler müssen eingreifen, ein Team von Kämpfern zusammenstellen und jeden Schritt dieses niederträchtigen Plans vereiteln, um letztendlich Krangs Vorhaben zu stoppen, die Erde in Dimension X zu verlagern.